Madrasah Aliyah Negeri Bangkalan dalam melaksanakan pembelajaran pada masa Pandemi Covid-19 ini melakukan pembelajaran jarak jauh dengan menggunakan aplikasi yang diluncurkan oleh Kementerian Agama Republik Indonesia yaitu E-Learning. Aplikasi ini menjadi hal baru dalam proses pembelajaran jarak jauh yang dilaksanakan oleh para Guru MAN Bangkalan agar para siswa tetap memperoleh pelajaran yang sama seperti belajar di Kelas.